2013年6月，城鎮職工醫保、居民醫保、新農合三類醫療保險機構整合為壹個“醫療保障基金管理中心”。該中心屬於市政府，暫由財政部門管理(主要考慮國家層面尚未整合的管理職責)。全市統籌，醫保由財政部門管理，是三明改革備受關註的特點。福建省三明市的醫改，直接解決了“以藥補醫”、“宰客”的頑疾，以組合拳堅決扭轉公立醫院創收讓利的機制，初步建立了保障公益性醫療的新體制，使醫院和醫生回歸到了治病救人的職責上。
法律依據:關於進壹步推廣福建省和三明市深化醫藥衛生體制改革經驗，深化醫療、醫保、醫藥聯動改革的通知。三明市按照騰籠換鳥的思路和換空間、調結構、保銜接的路徑，深化“三院”聯動改革，實行藥品耗材聯合限價采購。按照總量控制、結構調整、有升有降、逐步到位的原則，利用騰出的空間及時調整醫療服務價格，建立動態調整機制，優化醫院收入結構，建立公益性運行新機制。2018年，三明市公立醫院醫療服務收入(不含藥品、耗材、檢查化驗收入，下同)占醫療收入的42%。福建省全面跟進國家組織的藥品集中采購和使用試點，實行醫用耗材陽光采購，及時相應調整醫療服務價格。福建省醫療電子結算中心實現醫保基金對醫藥企業的直接支付結算。