專項附加扣除的申報方法如下:
1，扣繳義務人申報，扣繳義務人申報是按月專項附加扣除，由單位財務人員操作，納稅人可以在收入當月享受稅收優惠，比較適合收入來源單壹的納稅人；
2.年度綜合收益自行申報。當年綜合所得自行申報是先扣除個人所得稅，然後納稅人到地稅部門申請來年專項附加扣除，再由稅務部門申請退稅；
3.綜合所得年度自行申報更適合收入來源廣泛的人群。
專項扣稅的申報流程:第壹步是資料報送:納稅人向稅務機關報送相關資料或者納稅人向扣繳義務人報送資料後再報送稅務機關。專項附加扣除的相關信息包括:納稅人本人、配偶、未成年子女、贍養老人等個人身份信息。國務院稅務主管部門規定的其他與專項附加扣除有關的信息。專項附加扣除信息發生變化的，應當及時向扣繳義務人或者稅務機關提供相關信息。第二步信息核實:有關部門和單位應向稅務機關提供或協助核實專項附加扣除相關信息。
法律依據:《國務院直轄市關於印發〈個人所得稅專項附加扣除暫行辦法〉的通知》。
第八條納稅人在境內接受學歷(學位)繼續教育的費用，按照學歷(學位)教育期間每月400元定額扣除。同等學歷(學位)繼續教育的扣除期限不能超過48個月。納稅人用於技能人員和專業技術人員職業資格繼續教育的費用，按照取得相關證書當年3600元的定額扣除。第十四條納稅人或其配偶單獨或共同使用商業銀行或住房公積金個人住房貸款在中國境內為本人或配偶購買住房的，首次住房貸款發生的利息支出，按貸款利息實際發生當年每月1，000元的標準定額扣除，扣除期限最長不超過240個月。納稅人只能享受壹次首套房貸利息抵扣。
本辦法所稱首套房貸，是指購房時享受首套房貸利率的住房貸款。第十七條納稅人在主城區工作無自有住房和住房租賃支出，可按照以下標準扣除:
(壹)直轄市、省會城市、計劃單列市和國務院確定的其他城市，扣除標準為每月1500元；
(二)除第壹款所列城市外，市轄區戶籍人口100萬以上的城市，扣除標準為每月1100元；戶籍人口不超過654.38+0萬的城市，扣除標準為每月800元。
納稅人配偶在納稅人主要工作城市有自有住房的，視同納稅人在主要工作城市有自有住房。
市轄區戶籍人口以國家統計局公布的數據為準。