文件第十八條規定，單位和職工住房公積金繳存比例不得低於職工工資的5%，初步建立住房公積金制度的縣(市)可適當低於這壹比例。單位最高繳費率可提高到職工工資的15%，個人繳費率可提高到職工工資的10%。
但是，建設部門出具的文件只能是單位和個人繳納住房公積金的政策，不能用來計算代扣所得稅。住房公積金個人所得稅政策依據《財政部國家稅務總局關於基本養老保險、基本醫療保險、失業保險和住房公積金個人所得稅政策的通知》(財稅〔2006〕10號)的規定。根據這壹規定，單位和個人實際繳納的住房公積金，在不超過上壹年度職工月平均工資12%的範圍內，允許在個人應納稅所得額中扣除。也就是說，個人扣除不能超過12%，單位繳納不能超過12%，兩者不能合並計算為24%。
財稅[2006]10號文件還規定，單位和職工個人繳存住房公積金的月平均工資不得超過職工所在城市上壹年度職工月平均工資的3倍，具體標準按照當地有關規定執行。單位和個人繳存的住房公積金超過上述規定比例和標準的部分，並入個人當期工資、薪金所得，征收個人所得稅。因此，住房公積金的計算不能以“上壹年度職工月平均工資”為標準
為基數，但可以適當提高，但最高不得超過所在設區的市上年度職工月平均工資的3倍。
結合上述規定，企業直接以社會平均工資的3倍為基數是沒有問題的，但單位超過規定標準按照15%的比例繳納，高出的3%要結合當月的工資薪金計算扣繳個人所得稅。
如某單位職工黃，應發工資5438+10月份7800元，扣除個人住房公積金668.07元，基本養老保險費544.64元，失業保險費78元，扣除個人所得稅51.39元；單位繳納住房公積金1002.11元；當地去年社會平均工資為26723元。則黃的住房公積金稅前扣除標準為26723÷12×3×12% = 801.69(元)，單位實際扣除個人住房公積金為668.07元，不超過扣除標準可全額扣除；如果單位補繳1002.11元，超過了1002.11-801.69 = 200.42元的扣除標準，則應合並工資薪金扣繳個人所得稅。