公司通過銀行代發工資，必須要繳納稅款。
1、根據《中華人民***和國個人所得稅法》第二條規定 ;個人所得工資、薪金所得、勞務報酬所得；納稅人應當依法辦理納稅申報，並繳納個人所得稅：扣繳義務人應當按照國家規定辦理全員全額扣繳申報，並向納稅人提供其個人所得和已扣繳稅款等信息；
2、公安、人民銀行、金融監督管理等相關部門應當協助稅務機關確認納稅人的身份、金融賬戶信息。教育、衛生、醫療保障、民政、人力資源社會保障、住房城鄉建設、公安、人民銀行、金融監督管理等相關部門應當向稅務機關提供納稅人各項附加扣除信息；
3、個人所得稅以所得人為納稅人，以支付所得的單位或者個人為扣繳義務人。?納稅人有中國公民身份號碼的，以中國公民身份號碼為納稅人識別號；納稅人沒有中國公民身份號碼的，由稅務機關賦予其納稅人識別號。扣繳義務人扣繳稅款時，納稅人應當向扣繳義務人提供納稅人識別號。
擴展資料 :?
1、扣繳義務人應當按照國家規定辦理全員全額扣繳申報，並向納稅人提供其個人所得和已扣繳稅款等信息。納稅人向扣繳義務人提供專項附加扣除信息的，扣繳義務人按月預扣預繳稅款時應當按照規定予以扣除，不得拒絕；
2、有關部門依法將納稅人、扣繳義務人遵守本法的情況納入信用信息系統，並實施聯合激勵或者懲戒。納稅人、扣繳義務人和稅務機關及其工作人員違反本法規定的，依照《中華人民***和國稅收征收管理法》和有關法律法規的規定追究法律責任。
參考資料來源 :?中國人大網《中華人民***和國個人所得稅法》