壹、怎麽確認股權轉讓溢價
股權轉讓是企業轉讓其持有的股權的行為，而這個行為給企業帶來的結果就是獲取股權轉讓所得。按照相關規定，企業股權轉讓所得屬於轉讓財產所得，應以其股權轉讓收入扣除為取得該股權所發生的成本後的余額為股權轉讓所得。
二．在確認股權轉讓所得的過程中，要註意什麽？
1、允許扣除的股權成本為企業投資時實際交付的出資金額。對此《企業所得稅法實施條例》中已有明確：企業的各項資產，包括固定資產、生物資產、無形資產、長期待攤費用、投資資產、存貨等，以歷史成本為計稅基礎。前款所稱歷史成本，是指企業取得該項資產時實際發生的支出。企業持有各項資產期間資產增值或者減值，除國務院財政、稅務主管部門規定可以確認損益外，不得調整該資產的計稅基礎。
2、股權轉讓收入不得扣除被投資企業留存收益中所可能分配的金額。關於投資企業享有的被投資企業留存收益的份額究竟能否在轉讓收入中扣除的問題，原內資、外資企業所得稅法的規定並不相同。
3、非居民企業轉讓股權時的幣種換算問題。如果非居民企業初始投資時使用外幣投入資本，那麽應如何確認其股權轉讓所得呢。國稅函[2009]698號文對此明確：在計算股權轉讓所得時，以非居民企業向被轉讓股權的中國居民企業投資時或向原投資方購買該股權時的幣種計算股權轉讓價和股權成本價。也就是說應將轉讓價和成本價都換算為原投資時的幣種，進而計算出股權轉讓所得，再換算為人民幣計算應繳納的企業所得稅。
三、股權轉讓的印花稅處理
印花稅是對經濟活動和經濟交往中書立、領受具有法律效力的憑證的行為所征收的壹種稅。因采用在應稅憑證上粘貼印花稅票作為完稅的標誌而得名。目前，股權轉讓繳納印花稅主要分兩種情況：
1、根據財稅[2005]11號文件規定，買賣、繼承、贈與所書立的A股、B股股權轉讓書據，由立據雙方當事人分別按1‰的稅率，按照股權轉讓書據交納印花稅。2007年5月30日，該稅率已經由1‰調整為3‰.
2、根據國稅發[1991]155號文件規定，企業股權轉讓所立的書據，即除書立的A股、B股股權轉讓書據以外的股權轉讓合同，按照產權轉移書據，按所載金額的萬分之五繳納印花稅。織夢內容管理系統
外商投資者境內企業股權境外交易也應繳納印花稅。
法律依據：《中華人民***和國個人所得稅法》 第二條 下列各項個人所得，應當繳納個人所得稅：
（壹）工資、薪金所得；
（二）勞務報酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特許權使用費所得；
（五）經營所得；
（六）利息、股息、紅利所得；
（七）財產租賃所得；
（八）財產轉讓所得；
（九）偶然所得。居民個人取得前款第壹項至第四項所得（以下稱綜合所得），按納稅年度合並計算個人所得稅；非居民個人取得前款第壹項至第四項所得，按月或者按次分項計算個人所得稅。納稅人取得前款第五項至第九項所得，依照本法規定分別計算個人所得稅。