根據《哈爾濱市軌道交通壹期工程總體設計》(以下簡稱《總體設計》)顯示，1號線地鐵哈爾濱南站站至哈爾濱東站站段正線長17.73公裏，***設18座車站，平均站間距1.014公裏，最大站間距1.681公裏(哈爾濱南站站至農科院站間)，最小站間距0.706公裏(龍江街站至煙廠站間)。
18個地鐵站具體位置
哈爾濱南站站位於學府路下，該站分別在學府路兩側設立了4個出入口，6個風亭。車站采用地下二層島式車站型式，總長179米，凈寬17米，建築總面積9700平方米。其中地下壹層為站廳層，面積為6160平方米；二層為站臺層，面積為3540平方米。
農科院站位於學府路下，省農業科學院附近。車站***設6個出入口，其中4個分別設在學府路兩側，2個置於地下開發空間範圍內，西北角出入口與殘疾人通道合建。車站采用地下二層島式車站型式，總長258米，凈寬17米，總建築面積13995平方米。站廳層為8512平方米，站臺層為5483平方米。
醫大二院站位於學府路下，保健路口南側。車站***設8個出入口，分別沿保健路及學府路設置。地面***設6個風亭，分別位於西北及東北角。該站將成為4號地鐵線的換乘站。車站采用地下二層島式車站型式，總長170米，凈寬19米，總建築面積11206平方米。其中站廳層7361平方米，站臺層3845平方米。
黑龍江大學站位於學府路下，在學府四道街以北，市圖書館與服裝城之間。該站***設4個出入口，壹號口與哈爾濱服裝城開發改建相結合，二號口位於市圖書館門前規劃路北側，三、四號口位於黑龍江大學附近的人行道綠化帶內，地面***計建設6個風亭。車站采用地下二層島式車站，主體長160米，凈寬17米，總建築面積9814平方米。
理工大學站位於學府路下，在學府二道街口處。車站***設4個出入口，1號口位於黑龍江大學附近，2號口位於加油站附近，3、4號口位於理工大學附近。車站采用地下二層島式車站，總長160米，凈寬17米，總建築面積10170平方米，其中站廳層5730平方米，站臺層3300平方米。
電表廠站位學府路下偏東側，靠近路東的三角形綠地。車站設置4個出入口，1號口位於學府路西側靠近哈爾濱電表儀器廠，2號口位於自興路南側，3、4號口位於學府路東側。車站采用地下二層島式車站型式，主體長205米，標準段寬17米，總建築面積12480平方米。
清濱公園站位於西大直街下偏西側，和興路口以南。車站***設4個出入口。其中，3號口跨和興路，4號口跨大直街。是軌道交通1號線和3號線換乘車站，1、3號線***用的控制中心及主變電所設置在此。1號線車站內凈總長148米，標準段寬19米，主體建築面積6900平方米。
西大橋站位於西大直街下，通達街與漢祥街之間，是“7381”人防工程上壹個既有站。新建車站內凈總長134.5米，標準段寬13.2米。
教化廣場站位於西大直街下，上夾樹街口。地面***設4個出入口，均運分布在車站的四角。車站為對既有的“7381”人防工程進行改造，車站總長138米，凈寬23米，車站總建築面積9920平方米。
鐵路局站位於西大橋下，躍景街和公司街之間，是“7381”人防工程既有的車站。車站外包總長139.1米，標準段寬13.2米，總建築面積9350平方米。
博物館站位於東大直街下，博物館廣場北側，也是“7381”工程已建成的站，是與軌道交通2號線的換乘站。目前，車站的建設方案未定。
龍江街站位於東大直街下，在龍江街與鞍山街之間。本站在既有“7381”人防工程上新建的車站，遠期與5號線換乘。車站采用地下三層側式車站型式。
煙廠站位於東大直街下，燎原街與三姓街之間，與規劃4號線形成換乘。
工程大學站位於南通大街下，靠近文廟街口。在車站四角分設了4個入口，除東南角口布置於省軍區用地範圍內，其余入口距布置在南通大街兩側人行道的綠化帶內。車站采用地下二層島式車站型式，總長160米，凈寬17米，總建築面積9035平方米，站廳層5732平方米，站臺層3303平方米。
太平橋站位於南通大街下，東直路口西側。是1號線於3號線的換乘站，本站采用T形換乘。1號線車站采用壹島壹側式車站，3號線采用島式車站，1號線車站在上，3號線車站在下。
交通學院站位於東直路下，太平南三道街口處。車站***設6個出入口，1、6號口位於太平稅務局附近，2、3號口合設在建偉小學附近，4、5號口設在黑龍江工程學院附近。車站采用地下二層島式車站型式，車站主體長338米，標準段寬17米，總建築面積15864平方米。
南直路站位於樺樹街下，在南直路以西，太平體育場附近。車站 ***設4個出口。車站采用地下二層島式車站型式，車站主體長160米，標註段寬17米，總建築面積8758平方米。
哈爾濱東站站位於哈爾濱東站站前廣場下。車站的四個出入口和四組風亭延樺樹街布置，分別位於北棵頭道街和北棵街兩側。車站采用地下二層島式車站，車站長326.7米，標準段寬17米，主體建築面積13935平方米。
《總體設計》中顯示，本工程設車輛段1座，預留停車場1座。太平橋車輛段位於規劃平湖路以北、國鐵太平橋以南、馬家溝以東、新江橋街以西的地塊內，占地約25公頃。哈南站停車場位於哈南站以北30米處，占地約9.5公頃。
初定2009年元旦通車
《總體設計》顯示，為了滿足在2009年哈爾濱舉辦世界大學生冬季運動會前通車的要求，軌道交通壹期工程需在2008年底前完成。依次為目標安排的工程進度為：全線施工準備工作2005年3季度開始，2006年3季度完成；土建工程現場實施2005年底開始，2008年完成；全線區間土建工程2005年12月開始，2007年11月貫通；軌道鋪設2007年12月開始，2008年4月完成；車輛段土建工程2006年初開始，2007年7月完成；全線車站機電設備安裝和裝修2007年6月開始，2008年6月完成；全線系統試通車前聯動調試2008年7月至12月底；2009年1月1日試通車，直到12月31日為試運營；2010年1月提交國家驗收。
日運旅客21萬人次
運行過程中，每列車計劃由兩單元***6輛車組成，初期工程***需購車17列／102輛，因為要利用“7381”人防隧道，所以推薦采用2.8米寬、3.7米高的車型，同時推薦使用工藝成熟、價格相對較低的耐候鋼車體。6輛車編組的列車總長117.72米，車體最大寬度2.8米，車廂地板面至軌面高1.1米。每輛車開設4對對開門，門寬1.3米、高1.85米。
壹期輸送能力將達到每小時1.49萬人，全日客運量可達到21.2萬人次，可使全市地面公交日客運量減少4200車次。列車開通後，運營時間為5：00—23：00，全日運營時間***計18小時，規劃的初、近、遠期行車間隔時間壹般分別不大於8分鐘、5分鐘和4分鐘，每站停站時間最短為25秒，最長為35秒，站間距最短為722米(煙廠站至龍江街站)，最長為1681米(農科院站至哈南站站)。兩站之間運行時間最短為53秒，最長為127秒，由哈爾濱東站站至哈爾濱南站站下行線運行時間約為20.216分鐘，由哈爾濱南站站至哈爾濱東站站上行線運行時間大約為20.116分鐘。
地鐵站的先進設施
除了車輛、車站這些必備的設施外，《總體設計》中對壹些附屬設施也進行了規劃。 由於地鐵入口距地下站廳的距離較遠，在每個入口處都設置自動扶梯和直升電梯。其中，自動扶梯選用交通重載型自動扶梯，直升電梯采用額定載重1000Kg(13人)的無機房客貨兩用電梯。直升電梯按照每個車站至少有壹條無障礙通道供殘疾人使用。
預計在地鐵內設置工作照明和應急照明。照明燈布置在行車方向的左側墻壁上，每隔6米布置壹盞白熾燈具或節能型燈具，工作照明和應急照明相間布置，每隔兩盞工作照明燈設置壹盞應急照明燈，間隔為18米。燈具采用防潮、防腐、防震專用隧道燈，站臺層的照明以光帶照明為主。
同時，《總體設計》中充分考慮到了地鐵站內的通訊。地鐵開通後，有可能引入CDMA、GSM、DCS、小靈通、第三代移動通信、無線局域網的通信網，可以滿足人們正常的通訊。
地鐵的售票系統擬定采用自動和人工售檢票相結合。車站終端售票設備由自動售票機、人工售票機、進、出站檢票機等組成。自動售票機設置在非付費區，可以識別面值5角、1元的硬幣，也可以識別第四版和第五版面值10元、20元、50元人民幣，乘客可根據自己要去的目的地選擇票價不同的車票。人工售票機設在非付費區，負責向乘客發售各類型的車票。進、出站檢票機設計在付費區和非付費區分界處，經檢驗車票有效後，檢票機閘門方可打開。