截至2018年，哈爾濱市現有普通高校51所，成人高校11所，具有研究生培養資質的科研機構8所。
壹、哈爾濱工業大學
學校始建於1920年，1951年被確定為全國學習國外高等教育辦學模式的兩所樣板大學之壹，1954年進入國家首批重點建設的6所高校行列，是新中國第壹所畢業生直接被授予工程師稱號、研究生三年制的理工科大學。
二、哈爾濱工程大學
學校源自1953年創辦的中國人民解放軍軍事工程學院（哈軍工）；1970年，組建哈爾濱船舶工程學院；1981年成為首批具有博士、碩士學位授予權單位；1994年，更名為哈爾濱工程大學。
三、東北林業大學
東北林業大學創建於1952年7月，原名東北林學院，是在浙江大學農學院森林系和東北農學院森林系基礎上建立的，由原國家林業部直屬管理。1985年8月，更名為“東北林業大學”。2000年3月，由國家林業局劃歸教育部直屬管理。2010年11月教育部和國家林業局簽署協議、2012年3月教育部與黑龍江省人民政府簽署協議，合作***建東北林業大學。
四、黑龍江大學
誕生於1941年，其前身為中國人民抗日軍政大學第三分校俄文隊，是由中國***產黨壹手創辦的我國最早培養俄語高級專門人才的紅色大學。建校以來，黑龍江大學形成全國高校獨樹壹幟的對俄辦學特色，為國家外交、軍事、經貿、科技、文化、教育等各領域培養了21萬高級專門人才，其中包括數以萬計的黨和國家領導人、省部級官員、高級將領以及專家學者。
五、哈爾濱醫科大學
學校是1949年4月由原哈爾濱醫科大學和原興山（現鶴崗市）中國醫科大學第壹、二分校組建而成。2015年11月20日，黑龍江省人民政府、國家衛生計生委、教育部***建哈爾濱醫科大學。
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