海關大學有兩所，分別是上海海關大學和中國海關管理幹部學院。上海海關學院，直屬中華人民共和國海關總署，是經教育部批準的全日制普通高等學校。學校現設有海關與公共管理學院、海關與公共經濟學院、工商管理與海關學院、海關法律系、海關外語系、公共教育系、馬克思主義學院、檢驗檢疫技術交流系等八個系。中國海關管理幹部學院是壹所具有海關特色的壹流管理幹部學院，服務於海關隊伍建設，服務於業務改革，服務於關員成長，服務於國際社會。
材料補充:
1.上海海關大學是經教育部批準的全日制普通高等學校，直屬中華人民共和國海關總署。中國海關高等教育已有100多年的歷史。1908年，清政府在北京創辦稅務學堂(後更名為專門稅務學堂，遷至上海)，是世界上最早從事海關高等職業教育的學校之壹。新中國成立後，上海海關學校成立於1953。1980經國務院批準，升格為上海海關學院。1996更名為上海海關學院。2007年3月，教育部批準在上海海關學院的基礎上成立上海海關學院。2012 12，學校被國務院學位委員會正式批準為“國家特殊需要人才培養工程”——學士學位授予單位培養碩士學位畢業生試點單位。2014 11通過教育部本科教學工作合格評估。
2.中國海關管理幹部學院是經國家批準成立，中華人民共和國和海關總署直屬事業單位，教育部備案的成人教育學院。成立於1984。2012年3月，總署決定中國海關管理幹部學院遷址秦皇島，並於2012年10月22日正式投入運行。