建設工程清單報價，其建安工程費得稅金的計費是根據直接費基數來提取的，而直接費包括：人工費、材料費、機械費。根據工程造價相關規定，材料費是建築安裝工程費的組成部分，無論是甲方還是乙方采購供應的材料都應該進入建築安裝工程費，並計取相應的費、利潤和稅金。根據建設部《清單計價規範》，由甲方自行負責采購供應的材料費，投標人將“甲供材料”費進入綜合單價中計取相應的稅費，利潤後再將“甲供材料”費從綜合單價中扣除，這種形式的報價就包含了甲供材料稅金，在以後的申報繳納建築稅金時，甲方就不再另外支付甲供材料的稅金部分，乙方以後開具的建安發票也會包含甲供材料稅金在內，並且根據《建築安裝工程費用項目組成》（建標[2003]206號）第四條規定及相關稅法規定，營業稅金及附加是應計入建築安裝工程造價的，從而論證了甲供稅金是應進入甲方成本核算的。這是第壹種方式。
但是，在現實中，施工合同的簽訂會根據甲乙雙方約定的事項進行，乙方的施工報價會根據甲方要求，將建築稅金的計費基數剔除甲供材料後提取，這種形式的報價就不再包含甲供材料稅金。根據《中華人民***和國營業稅暫行條例實施細則》規定，納稅人提供建築業勞務（不含裝飾勞務）的，其營業額應當包括工程所用原材料、設備及其他物資和動力價款在內。由於工程稅金的繳納是按包含甲供材料金額的工程造價（即計稅營業額）計稅，因此，這時的甲供材料稅金就得由甲方單獨支付繳納，或支付給施工方繳納。這是第二種方式。
根據第壹種方式的論證過程，知道甲供材料稅金是應進入甲方成本核算的，但由於第二種方式下的甲供材料稅金不再由乙方開具在建安發票中，因此甲方要單獨將甲供稅金計入成本核算，從表象看起顯得蒼白無力，並且從費用處理上，要將甲供材料稅金進入成本核算也缺乏說服力；如果甲方通過營業外支出核算處理，則稅務機關壹般會認定為不能稅前扣除。
所以，下面就特別談談第二種方式下的甲供材料稅金的處理。
首先，開發企業的甲方應在成本核算中按建築材料、裝飾材料分別核算，便於分隔應繳納稅金的甲供建築材料，避免籠統將所有甲供材料計稅。
其次，如果按月與乙方結算工程款項，可以讓乙方將當月的甲供建築材料的稅金計算在結算金額中，合並開票給甲方，這其實是第壹種方式的按月合並法；如果采用最後竣工結算的方式，則可以在最後的結算中，把所有甲供建築材料應負擔的稅金計算在乙方的竣工結算中，以結算金額的形式支付甲供材稅金給乙方，由乙方繳納，取得建安發票計入成本。
最後，甲方的甲供材料是直接進入成本核算，對乙方的結算金額是以建安發票進入成本核算。這樣的處理，不違背財務制度，也不背離稅收法規，在稅收檢查中，也能正常通過。