1.遺失增值稅專用票:復印存根，交客戶所在地主管稅務局確認並開具扣稅憑證。報公司主管稅務局後，開具紅字發票沖抵原發票，再重新開具發票給客戶。如果稅款已經扣除，則不得重開。
2.如果普通發票丟失，復印存根並蓋章，用於客戶的賬戶。
財務人員應建立發票登記簿，登記購買發票的數量和號碼，發票的號碼、日期、客戶、金額、收款人，並送客戶會簽。
2.根據《增值稅專用發票使用規定》第二十八條規定，壹般納稅人遺失專用發票，抵扣聯。如果在損失之前已經被證明，
經買方主管稅務機關批準後，買方可使用賣方提供的相應專用發票記賬聯復印件和賣方當地主管稅務機關出具的增值稅專用發票已征稅遺失證明作為增值稅進項稅額抵扣憑證；
丟失前未認證的，買方憑賣方提供的相應專用發票記賬聯復印件到主管稅務機關認證。經認證的，由賣方當地主管稅務機關出具的《專用發票記賬聯》復印件和《增值稅專用發票遺失納稅申報表》經買方主管稅務機關審核批準後，可作為增值稅進項稅額抵扣憑證。
擴展數據:
增值稅壹般納稅人在開具增值稅專用發票時，經常出現銷售退回、發票退回等錯誤，需要開具新的增值稅專用發票。以下是針對幾種情況重新開具專用發票的政策問題進行梳理和總結。
收回原發票直接作廢處理，重新開具發票。
這種方法對出票人來說簡單、方便、快捷。《中華人民共和國國家稅務總局關於修改〈增值稅專用發票使用規定〉的通知》(國稅發〔2006〕156號)第十三條規定:
壹般納稅人當月開具專用發票、銷售退貨、開票錯誤等。，收到退回的發票並扣除符合無效宣告條件的，視為無效；如果簽發時發現錯誤，可以立即作廢。
作廢的專用發票在防偽稅控系統中按“作廢”處理，並在紙質專用發票(包括未打印的專用發票)的每份復印件上標註“作廢”字樣，所有復印件留存。但稅務機關對專用發票的作廢條件有相對嚴格的規定，必須同時滿足以下三個條件:
退回發票的收付時間不超過賣方開具發票的當月；賣家沒有抄稅，沒有記賬；購買方認證失敗或認證結果為“納稅人識別號認證不壹致”、“專用發票代碼和號碼認證不壹致”。
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