為遏制資源的粗放利用和無序開采，促進資源的保護、節約集約利用，推動經濟增長方式的轉變，發展循環經濟，促進經濟的可持續發展和更好地維護國家資源性資產的合法權益，國土資源部會同有關部門，貫徹落實《國務院關於加強地質工作的決定》和《國務院關於同意深化煤炭資源有償使用制度改革試點實施方案的批復》的精神，加快改革和制度建設，礦產資源有償使用制度進壹步完善，傳統體制下廉價或無償使用資源的情況已經改變，充分反映資源稀缺程度、市場供求關系和環境治理成本的資源價格形成機制初步建立，促進資源節約和集約利用的機制正在形成。
主要從以下幾個方面用經濟手段配合礦產資源管理政策的調整：
1、是深化礦業權有償取得。從 2006 年 10 月起，全面實現礦業權有償取得制度。落實《國務院關於同意深化煤炭資源有償使用制度改革實施方案的批復》（國函〔2006〕102 號）的要求，積極推進煤炭資源有償使用制度改革試點工作，在貴州等 8 個煤炭主產省進行煤炭資源有償使用制度改革試點工作，其核心是建立起煤炭資源勘查、開發合理成本負擔機制以及煤炭開采綜合補償和生態環境恢復補償機制。
印發了《關於深化探礦權采礦權有償取得制度改革有關問題的通知》（財建〔2006〕694 號）和《關於探礦權采礦權有償取得制度改革有關問題的補充通知》（財建〔2008〕22 號），進壹步明確了加快推進改革試點工作的有關要求，並對礦業權價款有償處置的範圍，已轉增為國家資本金的礦業權價款的清理，礦業權價款的分成等問題進行了規定。同時，進壹步規範了礦產資源勘查、開發秩序的管理，對礦權人已經占有、無償取得礦業權的清理工作已逐步展開。
2、是完善礦產資源稅費制度，積極推進資源稅改革。印發《關於加強礦產資源補償費征收管理，促進煤礦回采率提高的通知》、《關於加強礦產資源補償費征收管理的通知》等文件，在開展礦山儲量動態監測基礎上，全面復查核定開采回采率，規範確定開采回采率系數，積極探索補償費征收與儲量消耗掛鉤的政策措施，建立礦業權人珍惜利用資源的經濟機制。
法律依據：
《關於將國有土地使用權出讓收入、礦產資源專項收入、海域使用金、無居民海島使用金四項政府非稅收入劃轉稅務部門征收有關問題的通知》
第壹條將由自然資源部門負責征收的國有土地使用權出讓收入、礦產資源專項收入、海域使用金、無居民海島使用金四項政府非稅收入(以下簡稱四項政府非稅收入)，全部劃轉給稅務部門負責征收。自然資源部(本級)按照規定負責征收的礦產資源專項收入、海域使用金、無居民海島使用金，同步劃轉稅務部門征收。
第二條征管劃轉工作將先試點後推開。自2021年7月1日起，選擇在河北、內蒙古、上海、浙江、安徽、青島、雲南省(自治區、直轄市、計劃單列市)以省(區、市)為單位開展征管職責劃轉試點，探索完善征繳流程、職責分工等，為全面推開劃轉工作積累經驗。暫未開展征管劃轉試點地區要積極做好四項政府非稅收入征收劃轉準備工作，自2022年1月1日起全面實施征管劃轉工作。
第三條稅務部門按照屬地原則征收四項政府非稅收入。原由自然資源部(本級)負責征收的礦產資源專項收入、海域使用金、無居民海島使用金等非稅收入，征管職責劃轉後的具體工作由國家稅務總局北京市稅務局承擔。