調任到揚州。武宗南巡到揚州，蔣瑤只是提供皇帝的用具而已，沒有贈送的東西。各位嬖幸都很生氣。江彬想搶奪富民的住房作為威武副將軍府，蔣瑤執意不可。江彬氣憤蔣瑤挫辱他，就用皇帝所賜的銅瓜威脅他，蔣瑤不為之所懾服。恰逢皇帝打漁獲得壹條巨魚，戲言說價值五百金，江彬就誣告蔣瑤責備他的正直。蔣瑤懷揣他的妻子的簪珥、袿服進言，說：“金庫沒有錢，臣所有的只是這些。”皇帝笑然後打發他走。揚州府以前有瓊花觀，皇帝下詔索取瓊花。蔣瑤說自宋徽、欽北狩，此花已經滅絕，現在沒有可以用來進獻的。又傳旨征收異物，蔣瑤都說不是揚州出產的。皇帝說：“苧白布，也不是揚州出產的嗎？”蔣瑤不得已，給皇帝進獻了五百疋。那個時候，當權的認為揚繁華，要求無所不至，而且輕視蔣瑤，平民已經十分困苦。禦駕回京，瑤扈到了寶應。宦官邱得用以鐵糸亙捆綁蔣瑤，數日才釋放，竟然隨行到臨清才返回。揚州人看見蔣瑤，沒有不感動哭泣的。到升遷為陜西參政的時候，爭相出資修建祠堂來祭祀他，名聲自此大震。
嘉靖初，歷任湖廣、江西左、右布政使，以右副都禦史巡撫河南。皇帝命令桂萼等審核巡撫官的去留，讓蔣瑤回京等候調動。後來，累遷為工部尚書。四郊工竣，加太子少保。西苑宮大殿修成，皇帝設置宴會。看見蔣瑤和王時中的席在外面，命令移至殿內，然後移皇親到殿右來讓蔣瑤，說：“親近親人不如尊重賢才。”他重視蔣瑤如此。當時土木繁興，壹年花費數百萬錢。蔣瑤規畫都說是皇帝的意思，好幾次給與錢幣。因為丁憂去官。很久之後，自南京工部尚書，皇帝下召改為北京工部尚書。皇帝臨幸承天，蔣瑤隨從。京師建立營，所率役的京軍，多為豪家所占匿。到那個時候大興土木仍然很頻繁，每年招募平民充當勞役，花費二百余萬錢。蔣瑤為這個說話，因請停不急者。豪家所藏匿的軍人都出來，招募花費大減。因為年老致仕。
蔣瑤端亮清介。已經退休，居住在陋巷之中。和尚書劉麟、顧應祥等人結了壹個文酒社，徜徉於峴山之間。卒年八十九。贈太子太保，謚恭靖。