免稅種苗發票抵扣政策是指種苗抵扣稅款，減輕企業負擔的政策。作為農產品，種苗的購買和處置需要遵循相關的會計法規和政策。
購買農產品時，可以從增值稅專用發票或者海關進口增值稅繳款書中扣除，也可以從農產品收購發票或者農產品銷售發票上註明的農產品收購價格和13%中扣除。種苗作為農產品，也有此規定，但在領取免稅種苗發票時不能抵扣。
種苗發票抵扣政策如下:
1，農業生產者銷售的自產農產品免征增值稅；
2.農產品收購發票，是指收購單位從個體農業生產者手中收購自產免稅農產品時，由付款方開具給收款方的發票；
3.取得農產品銷售發票或者收購發票的，按照農產品銷售發票或者收購發票上註明的農產品收購價格和扣除率11%計算進項稅額；
4.2065438年4月1日至2009年4月65438日，原扣除率10%的，扣除率調整為9%。納稅人購進農產品用於生產或者委托加工貨物，稅率為13%的，按照10%的抵扣率計算進項稅額。
綜上所述，在購買和加工苗木時，需要註意相應的會計記錄。企業需要記錄預付款項、生物資產賬戶等相關信息。企業在領取種苗免稅發票時，應認真核對發票上的信息，確保其符合稅收政策規定，準確記錄相關會計信息。
法律依據:
《中華人民共和國增值稅暫行條例》第八條
納稅人購買貨物、勞務、服務、無形資產和不動產所支付或承擔的增值稅為進項稅。下列進項稅允許從銷項稅中扣除:
(1)從賣方取得的增值稅專用發票上註明的增值稅。
(2)從海關取得的海關進口增值稅專用繳款書上註明的增值稅。
(三)購進農產品，除取得增值稅專用發票或者海關進口增值稅專用繳款書外，按照農產品收購價格和農產品收購發票或者銷售發票註明的扣除率11%計算進項稅額，國務院另有規定的除外。進項稅計算公式:進項稅=進項價乘以扣除率。
(四)從境外單位或者個人購買勞務、服務、無形資產或者境內不動產，從稅務機關或者扣繳義務人取得的代扣代繳稅款完稅憑證上註明的增值稅。扣除項目和扣除率的調整由國務院決定。