民間非營利組織應交稅金是按照國家稅法規定應當繳納的各種稅費，如營業稅、增值稅、所得稅、房產稅、個人所得稅等。這些應交的稅金，要按照權責發生制的原則預提計入有關科目。應交的稅金在尚未交納之前暫時停留在民間非營利組織內部，形成壹定的負債。
（壹）應交營業稅
營業稅的征收範圍包括：在中國境內提供交通運輸、建築、金融保險、郵電通訊、文化體育、娛樂、服務等服務，有償轉讓無形資產，銷售不動產等。營業稅按照營業額和稅率計算應納稅額，民間非營利組織發生營業稅納稅義務時，按照規定應繳納的營業稅，借記“業務活動成本”科目，貸記“應交稅金—應交營業稅”科目。
交納稅時，借記“應交稅金——應交營業稅”科目，貸記“銀行存款”科目。
（二）應交增值稅
增值稅是對在中國境內銷售貨物或提供加工、修理修配勞務，以及進口貨物的單位和個人，就其取得的貨物或應稅勞務，以及進口貨物的增值部分征收的壹種流轉稅。
增值稅的納稅人按其經營規模及會計核算資料是否健全分為壹般納稅人和小規模納稅人。按稅法規定，以從事貨物生產或提供應稅勞務，以及從事貨物生產或提供應稅勞務為主，並兼營貨物批發或零售的納稅人，年應稅銷售額在100萬元以下的；從事貨物批發或零售的，年應稅銷售額在180萬元以下的；以及應稅的銷售額超過規定的標準，但會計核算不健全或不能提供準確的稅務資料的；或雖符合壹般納稅人條件但不能申請壹般納稅人認定手續的，均應視為小規模納稅人。除此之外的其他增值稅納稅人為壹般納稅人。
1.小規模納稅人應交納增值稅的核算:
根據《增值稅暫行條例》規定，小規模納稅人增值稅核算的特點有：
壹是小規模納稅人銷售貨物或提供應稅勞務，壹般情況下只能開具普通發票，不能開具增值稅專用發票；
二是小規模納稅單位銷售貨物工提供應稅勞務，實行簡易辦法計算應納稅額，按照銷售額的6%或4%計算。
三是小規模納稅人的銷售額不包括其應納的增值稅額。采用銷售額和應納稅額合並定價方法的，按照公式先將其還原為不含稅銷售額，再計算應納稅額。
實際上交增值稅時，借記“應交稅費—應交增值稅”科目，貸記“銀行存款”科目。
2.壹般納稅人應交增值稅的核算:
若為壹般納稅人，單位銷售貨物或提供應稅勞務可以開具增值稅發票（或完稅憑證或購進免稅農產品憑證或外購貨物支付的運輸費用的結算單據）；購入貨物取得的增值稅專用發票上註明的增值稅可以抵扣銷項稅額。如果單位銷售貨物或提供應稅勞務采用銷售額和銷項稅額合並定價方法的，應先將含稅銷售額換算為不含稅銷售額，再按不含稅銷售額計算出銷項稅額。
壹般納稅人在購銷業務上的賬務理的特點有：
壹是在購入貨物時，賬務處實行價稅分離，價稅分別依據增值稅專用發票上註明的價款與增值稅額，價款計入購入貨物成本，增值稅額計入進項稅額；
二是在銷售貨物時，向購貨方收取的（或應收取的）屬於價款部分的計入當期收入，屬於增值稅部分的計入銷項稅額；
三是期末應上交的增值稅的金額是當期的銷項稅額與當期進項稅額的差額。
（三）應交房產稅、土地使用稅、車船稅
房產稅是國家對城市、縣城、建制鎮和工礦區征收的由產權所有人繳納的壹種稅。房產稅依照原值壹次減除10%至30%後的余額計算交納。沒有房產原值為依據的，由房產所在地稅務機關參考同類房產核定；房產出租的，以房產租金收入為房產稅的計稅依據。
土地使用稅是國家為了合理利用城鎮壓土地，調節土地級差收入，提高土地使用效益，加強土地管理而開征的壹種稅，以實際占有的土地面積為計稅依據，依照規定稅額計算征收。
車船稅由擁有並且使用車般單位和個人繳納。車船稅依照適用稅額計算交納。
民間非營利組織按規定計算應交的房產稅，借記“管理費用”科目，貸記“應交稅金—－應交房產稅”科目。
實際上繳時，借記“應交稅金—－應交房產稅”科目；貸記“銀行存款”科目；
土地使用稅、車船稅直接交納，不通過“應交稅金”科目，交納時，借記“管理費用”科目，貸記“銀行存款” “現金”科目。
（四）應交個人所得稅
1.個人所得稅的納稅範圍。個人所得稅是對個人（自然人）取得的各項應稅所得征收的壹種稅。個人所得稅的納稅義務人包括中國公民、個體工商戶以及在國內有所得的外籍人員（包括無國籍人員）和香港、澳門、臺灣同胞。
個人所得稅應納稅所得額包括：工資、薪金所得、個體工商戶的生產、經營所得，對企事業單位的承包經營、承租經營所得、勞動報酬所得、稿酬所得、特許權使用費所得，利息、股息、紅利所得，財產租賃所得，財產轉讓所得偶然所得，經國務院財政部門確定征收的其他所得。
2.個人所得稅的核算。民間非營利組織個人所得稅，按規定應由單位代扣代交。按規定計算的個人所得稅，借記“應付工資”科目，貸記“應交稅金—－應交個人所得稅”科目。
（五）應交所得稅
1.所得稅的定義。所得稅是指國家對境內企業生產經營所得和其他所得依法征收的壹種稅。所得稅的納稅義務人是指在中國境內實行獨立經濟核算的企業或者組織。應交所得稅的計算公式：
應交所得稅=應納稅所得×適用稅率
2.所得稅的核算。按照《民間非營利組織會計制度》規定，民間非營利組織如果發生了所得稅的納稅義務時，按照規定計算應交納的所得稅，借記“其他費用”科目，貸記“應交稅金－－應交所得稅”科目。繳納所得稅時，借記“應交稅金—－應交所得稅”科目，貸記“銀行存款”科目。