納稅申報時系統提示抵扣稅額與實際不符，壹般是認證了的發票申報數據不對。
增值稅納稅申報的時候，進項稅額要求必須是當期到稅務局認證通過的發票才可以抵扣的，所以如果在申報表上填的金額跟稅務局認證的金額不符的話，就會這麽提示。
重新清理下當月認證通過了的發票，重新計算進項稅額填寫之後再申報試試。
根據稅法規定的增值稅壹般納稅人申報表填寫次序為：固定資產進項稅額抵扣情況表（必填）；
附表壹（必填）；
附表二（必填）；主表（必填）。成品油購銷存情況明細表（非必填）；
附表三（改征增值稅納稅人必填，其他納稅人不需填寫）；四小票（非必填）；稽核數據結果清單確認（輔導期納稅人必填，其他納稅人不需填寫）。
擴展資料：
(1)企業、企業在外地設立的分支機構和從事生產、經營的場所，個體工商戶和從事生產、經營的事業單位(以下統稱從事生產、經營的納稅人)自領取營業執照之日起30日內，持有關證件，向稅務機關申報辦理稅務登記。稅務機關應當自收到申報之日起30日內審核並發給稅務登記證件。
(2)從事生產、經營的納稅人，稅務登記內容發生變化的，自工商行政管理機關辦理變更登記之日起30日內或者在向工商行政管理機關申請辦理註銷登記之前，持有關證件向稅務機關申報辦理變更或者註銷稅務登記。
(3)從事生產、經營的納稅人應當按照國家有關規定，持稅務登記證件，在銀行或者其他金融機構開立基本存款賬戶和其他存款賬戶，並將其全部賬號向稅務機關報告。
(4)納稅人按照國務院稅務主管部門的規定使用稅務登記證件。稅務登記證件不得轉借、塗改、損毀、買賣或者偽造。
百度百科-納稅申報