（壹）辦公室
負責制定本局辦公規章制度；制定年度工作計劃及長遠發展規劃；處理日常政務，起草和審核有關文件和報告；負責財務及資產管理；負責後勤保障工作；負責文秘事務、網站管理、文書檔案、文印、信訪、保密、調研、信息宣傳、目標管理考核、督查督辦、綜合行政管理信息系統管理等機關行政事務工作；辦理人大代表建議、政協委員提案；協助領導對有關工作進行綜合協調；負責上級對口處室的目標責任制考核；承辦領導和上級交辦的其他工作。
（二）人事教育監察科
負責制定本局人教監察、文明創建和黨群管理制度；負責本局機構編制、工資福利、任免調配、考核獎懲、交流、辭職辭退、專業技術職務、外出及請休假管理、幹部人事檔案、人事統計等人事管理工作;負責離退休幹部及提前離崗人員的管理和服務；負責思想政治工作、精神文明建設、國稅文化建設等基層建設工作；負責教育培訓工作；負責黨建、工會、***青團和婦聯等黨群工作；負責紀律監察、黨風廉政和糾風工作；負責上級對口處室的目標責任制考核；承辦領導和上級交辦的其他工作。
（三）綜合選案科
負責制定全市國稅系統稅收檢查計劃，分配稽查任務，組織落實稅務稽查政策法規和上級工作要求；負責全市國稅稽查工作的指導、管理、考核和稽查納稅服務管理；負責全市國稅稽查信息化管理；負責全市國稅專項檢查和專項整治工作；負責全市國稅稽查案件督辦、跟蹤管理、組織案件復查和大要案管理；負責全市國稅系統稅務檢查證管理；負責全市國稅稽查辦案經費管理；負責全市國稅稽查數據、信息統計，報表編制以及綜合文字工作；負責與公安、地稅、工商、海關等部門的工作聯絡和協調，配合紀檢監察、法制部門開展涉稅案件調查；負責公告、曝光案件的收集、整理和上報；負責上級對口處室的目標責任制考核等工作；承辦領導和上級交辦的其他工作。
（四）案件審理科
負責本局查處案件的審理工作；對市局審理的重大稅收違法案件提出初審意見；負責對全市國稅稽查案件審理工作進行指導和管理；負責全市國稅稽查文書規範工作；負責本局稽查案件卷宗的歸檔管理；負責本局稅收法制工作；負責涉稅犯罪案件移送管理；負責全市國稅稽查系列與管理系列聯動管理；負責全市國稅稽查建議、查後建議的管理，組織全市國稅稽查能手、優秀稽查建議、優秀案例等評選；負責全市國稅稽查系列政策業務培訓，參與疑難案件的政策協調；負責上級對口處室的目標責任制考核；承辦領導和上級交辦的其他工作。
（五）案件執行科
負責本局查處的稽查案件的執行工作；負責對全市國稅稽查案件執行工作的業務指導和管理；負責上級對口處室的目標責任制考核；承辦領導和上級交辦的其他工作。
（六）稅務違法案件舉報中心
負責全市國稅違法案件舉報的受理、登記、查辦、轉辦、交辦、催辦、反饋以及綜合管理工作；負責上級下發舉報案件的轉辦、督辦、上報工作；對受理的應由本局查處的壹般舉報案件進行查處；負責全市國稅舉報獎勵管理；負責全市國稅金稅工程協查系統管理；負責全市國稅外地來人來函協查管理；負責全市國稅稽查“第三類案件”（上級稅務機關通過金稅稽核系統比對生成的案件）管理；負責上級對口處室的目標責任制考核；承辦領導和上級交辦的其他工作。
（七）檢查壹、二、三科
負責根據本局下達的稽查計劃開展日常稅收檢查，按規定整理並向審理部門移交案卷資料，協助做好案件執行工作；負責所查案件的稽查建議、案例分析以及案件聽證、復議、訴訟等事項的舉證工作；負責上級及本局下達的重大稅收違法案件查處工作；承辦領導和上級交辦的其他工作。