現結合稅收案例分析。
某公司2014年發生有關債券投資業務如下：
1.2014年4月1日取得到期國庫券利息收入10萬元。
2.2013年5月12日以100.5萬元在滬市購買記賬式國債（單位面值為100元，***計面值100萬元），該國債起息日為2013年4月21日，每年4月21日兌付利息，票面利率為3％。2014年3月8日，該公司將購買的國債轉讓，取得轉讓價款105.5萬元。
3.2013年4月1日在某商業銀行債券市場認購了某地方政府發行的2013年債券，票面金額合計80萬元，票面註明年利率為1.5％，付息日期為每年4月1日。在2014年4月1日，該公司收到地方政府債券利息收入1.2萬元，並於同年7月1日將該債券轉讓，轉讓價款合計83.5萬元。
4.取得其他公司債券利息收入15萬元。
全年會計利潤300萬元，企業所得稅稅率25％。若無其他納稅調整事項，計算企業所得稅及稅後凈利潤。
案例分析
1.國庫券利息收入免稅；
2.在兌付期前轉讓國債的，應在國債轉讓收入確認時確認利息收入的實現；
3.國債持有者在二級市場轉讓國債取得的收入，應征收企業所得稅；
4.地方政府債券利息所得免征；
5.其他債券利息收入應征收企業所得稅。
上述業務1中取得的國庫券利息收入10萬元免稅；業務2中的國債持有天數為300天（從2013年5月12日到2014年3月7日），國債利息2.46萬元[100×（3％÷365）×300]，國債轉讓所得2.54萬元（105.5－2.46－100.5）應申報納稅；業務3取得的地方債券利息收入1.2萬元免征，轉讓地方政府債券投資所得3.5萬元（103.5－100）應申報納稅。
計算如下：
應納稅所得額＝300－10－2.46－1.2＝286.34（萬元）
應納企業所得稅＝286.34×25％＝71.59（萬元）
稅後凈利潤＝300－71.59＝228.41（萬元）。
政策依據
1.國債利息收入免稅法定
《企業所得稅法》第二十六條明確企業取得的“國債利息收入”為免稅收入，其實施條例對其具體範圍作出了更為明確的規定。稅法規定的免稅國債利息收入，是指企業持有國務院財政部門發行的國債取得的利息收入，不包括持有外國政府國債取得的利息收入，也不包括持有企業發行的債券取得的利息收入，而僅限於持有中國中央政府發行的國債。
換言之，對由外國政府發行的國債利息收入應計征企業所得稅。
值得註意的是，稅法雖規定國債利息收入為免稅收入，但並不意味著與國債有關的收入都可以免稅，對於國債持有者在二級市場轉讓國債取得的收入，應作為轉讓財產收入計算繳納企業所得稅。
2.地方政府債券利息所得免征
為增強地方安排配套資金和擴大政府投資的能力，國家允許發行地方政府債券，且實行財政部代理發行和還本付息的辦法。在這種“代辦”模式下，地方債信用等級接近於國債。根據《財政部、國家稅務總局關於地方政府債券利息所得免征所得稅問題的通知》（財稅〔2011〕76號）及《財政部、國家稅務總局關於地方政府債券利息免征所得稅問題的通知》（財稅〔2013〕5號）規定，對稅法規定的債券利息免稅收入擴圍，將企業和個人取得的2009年、2010年、2011年、2012年及以後年度發行的地方政府債券利息收入，列入免征企業所得稅和個人所得稅範圍。
註意事項
到期前轉讓國債利息收入的確認。根據《國家稅務總局關於企業國債投資業務企業所得稅處理問題的公告》（國家稅務總局公告2011年第36號），對企業到期前轉讓國債、或者從非發行者投資購買的國債，其持有期間尚未兌付的國債利息收入，按以下公式計算確定：國債利息收入＝國債金額×（適用年利率÷365）×持有天數。
債券利息收入免征實行自行申報管理方式，無須審批。
申報時須提交資料清單：
1.購買國務院財政部門發行的國債及取得利息的證明資料；
2.購買地方政府債券及取得利息的證明資料。