1、登錄上海市電子稅務局，依次點擊菜單欄“我要辦稅”-“壹般退（抵）稅管理”-“退抵稅費申請（增值稅制度性留抵退稅）”，進入辦理頁面。
2、系統彈出辦理須知，點擊“繼續辦理”進入留抵退稅申請表填寫界面。
3、填寫基本信息。
4、根據提示點擊“返回修改”可繼續填寫修改原申請信息，點擊“繼續申請”進到下壹環節。
5、提交成功後，可以進“我要查詢-辦稅進度及結果信息查詢”跟蹤事項辦理進度；同時支持納稅人點擊“撤銷申請”。