根據《國家稅務總局關於印花稅若幹具體問題的解釋和規定的通知》(91國稅發155號)“在代理業務中，代理機構與委托單位簽訂的，僅明確代理事項、權限和責任的代理合同，不屬於應稅憑證，不加蓋印花”。因此，如果外貿企業與委托人簽訂的代理合同只約定代理事項、權利和責任，則不屬於應稅憑證，不需要蓋章。
所有明確規定了發貨人與發貨人之間業務關系的運輸單據，都屬於合同性質。規定運費結算憑證作為各種運費的計稅憑證。直接辦理運費結算憑證的雙方均為運費憑證印花稅的納稅人。稅目“貨物運輸合同”。按運輸費用萬分之五貼貼花。
所以物流公司開具的代理貨運發票(6%增值稅發票)需要繳納印花稅。
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