為員工發放購物卡也是要納個人所得稅的。
由於國家稅務局稅收政策有明確規定，對於任職受雇單位發放給個人的不管是現金還是實物，都要依法繳納個人所得稅，所以對於用超市購物卡作為職工福利發放給員工的行為，員工的這些收入不屬於免稅的福利費範圍，應當並入納稅人的（工資、薪金）所得，按規定計算繳納個人所得稅。
擴展資料：
《中華人民***和國個人所得稅法實施條例》第六條關於工資薪金所得的界定,是指個人因任職或者受雇而取得的工資、薪金、獎金、年終加薪、勞動分紅、津貼、補貼以及與任職或者受雇有關的其他所得。個人所得的形式，包括現金、實物、有價證券和其他形式的經濟利益。
發放福利時入賬
1、公司購買超市購物卡時的會計分錄
借：預付賬款——購物卡
貸：銀行存款
2、此卡作為福利發放給本公司員工，屬於職工福利費，會計分錄：
借：應付職工薪酬——職工福利費
貸：預付賬款——購物卡
3、月底分配福利費時
借：管理費用——職工福利費
貸：應付職工薪酬——福利費
百度百科-中華人民***和國個人所得稅法實施條例