2、如果企業長期零報稅，可能被稅務納入為走逃戶，納入走逃戶很嚴重，會被納入重大的失信黑名單中並且對外公告，還會被評定為D級的納稅人，被評為D級納稅人，就得承擔D級納稅人的所有後果。
3、如果企業長期零報稅，並且納稅人持有發票的，則發票就會被稅務降板降量，還要納稅人定期到稅務機關進行發票核查。
4、如果企業長期零報稅，被稅務機關核查到，稅務局就會采用成本費用的公司來核定納稅人的收入。在稅務機關辦理了稅務登記的納稅人、扣繳義務人當期未發生應稅行為，按照國家稅收法律、行政法規和規章的規定，應向稅務機關辦理零申報手續，並註明當期無應稅事項。通俗地講，納稅申報的所屬期內（如11月申報所屬期為10月份）沒有發生應稅收入（銷售額），同時也沒有應納稅額的情況，稱為零申報。連續三個月零申報屬於異常申報，列入重點關註對象。