自1994年新疆維吾爾自治區地方稅務局成立以來，承擔著新疆166萬平方公裏的征收管理工作，主要征收營業稅、企業所得稅、個人所得稅等13個稅種。全區地稅系統下設19個地州市地稅局（不包括直征局和稽查局），86個縣（市、區）地稅局，其他直屬派出機構22個，294個基層稅務所。