作廢退稅申請的步驟是：提交退稅申請後，在稅務機關終審前可以作廢申報，但是，如果稅務機關審核通過已經提交國庫部門的，不能作廢申報，只能在前次申報基礎上辦理更正申報。若妳發現申報錯誤需要修改，可通過更正申報進行處理。如果已經申請退稅並已進入國庫辦理環節，這時候要等國庫辦理結束之後再按上述操作進行更正申報。
退稅申請提交後可以申請報廢，且申請作廢也不會對個人造成什麽影響。
因此已作廢退稅申請應當不會被查。