綜合治稅辦公室由稅務部門負責的。綜合治稅辦公室，就是由國家稅務部門牽頭在公安、城管、街道等多部門參與的有關稅務整治的聯合辦公室。
主要是負責綜合治稅的組織、管理和指導工作，制定綜合治稅工作實施意見及方案。