收到增值稅專用發票，按照發票上註明的稅額抵扣增值稅，勾選認證抵扣即可，無需額外計算準予抵扣的進項稅額。
核定扣除是指納稅人按稅務機關確定的方法和審定的扣除標準計算當期允許抵扣的農產品增值稅進項稅額，而不再憑增值稅扣稅憑證抵扣增值稅進項稅額。
投入產出法：
納稅人以購進農產品為原料生產貨物的，適用投入產出法進行核定扣除。
當期允許抵扣農產品增值稅進項稅額=當期農產品耗用數量×農產品平均購買單價×扣除率÷（1＋扣除率）
當期農產品耗用數量=當期銷售貨物數量×農產品單耗數量
其中，扣除率為銷售貨物的適用稅率，目的是為了體現增值稅對增值額征稅的特點，使得最終產品銷項計算稅率和它的原料進項計算稅率相壹致。農產品單耗數量是參照國 家標準、行業標準確定的，不是納稅人的個別標準。