聯邦財政部和各州財政部***同構成德國稅務管理的高層機構。聯邦財政部主要通過其所屬的聯邦稅務總局（Bundesamt für Finanzen）履行有關稅收規劃和管理的職能。聯邦財政部和州財政部每年定期召開聯席會議，就稅收政策、分享比例等問題進行協商，二者無指導或領導關系，系平級機構。
高等稅政署（Oberfinanzdirektion）是德國稅務管理的中層機構，負責轄區內稅法和有關征管規定的實施，並就與稅收相關的問題在聯邦和州政府間進行協調，其轄區和所在地由聯邦和各州協商確定。高級稅政署內設分管聯邦稅和地稅事務的多個部門。管理聯邦事務的部門壹般包括關稅與消費稅處、聯邦財產處等；管理州事務的有財產稅與流轉稅處、州財產處等。德國現有18個高等稅政署，在巴符州、巴伐利亞州和北威州各設2個，不來梅州沒有，其他州各設1個。
地方稅務局（Finanzamt）是德國稅務管理的基層機構，負責管理除關稅和由聯邦負責的消費稅（Verbrauchsteuer）之外的所有稅收。企業和個人報稅、繳稅和申請減、免、退稅都需到註冊地或居住地的地方稅務局辦理。