如果電商有增值稅交易，就應該繳納增值稅。小規模納稅人交4%，壹般納稅人交17%，但進項稅可以抵扣。
擴展數據:
電子商務公司應繳納的稅款:
1，增值稅=商品銷售收入(不含稅)*3%(小規模納稅人，月報表)；
增值稅=商品銷售收入(不含稅)*17%(增值稅壹般納稅人，月報表)；
營業稅=咨詢、服務、廣告收入*5%(月報)；
2.應交城建稅=應交增值稅和應交營業稅*7%(月報)；
3.應交教育費附加=應交增值稅和應交營業稅*3%(月報)；
4.堤防保護費:營業收入*0.02%(有的地方不收)(月報)；
5.所得稅=利潤總額*稅率25%(季度)；(符合條件的小型微利企業所得稅稅率為20%，小型微利企業是指從事國家未限制或禁止的行業，且符合下列條件的企業:工業企業，年應納稅所得額不超過30萬元，從業人員不超過100人，資產總額不超過3000萬元；其他企業，年應納稅所得額不超過30萬元，從業人數不超過80人，資產總額不超過654.38+00萬元)，壹般營業稅稅率為5%。
6.個人所得稅(月報)；代扣代繳，無論工資是否超過2000元，所有員工都要全額申報。應納個人所得稅(個人根據其工資、薪金所得計算的應納稅額，扣除免稅的“五險壹金”等應由個人負擔的項目後的余額，再扣除允許扣除的費用2000元，為應納稅所得額。應納個人所得稅=應納稅所得額*適用稅率-速算扣除。