1.確認和測量困難。風險成本確認的時間和金額不確定，如何量化不好解決。
2.報告和披露方面的困難。風險成本的不確定程度不同，相應的披露方式也不同。風險成本報告模式與現行財務報告的銜接存在諸多問題。
3.決策和控制困難。風險成本決策和控制受到不確定性的影響，相關制度的建立需要傳統模型的創新。
4.風險成本是否應記入資產負債表。對於同類風險，是根據各自的行業確定風險度量的標準，還是制定統壹的風險度量標準，也是壹個難題。
5.風險成本管理會計的組織體系構建。需要考慮是維持原有的企業層級進行風險成本管理，還是分離出壹個自上而下的組織體系進行獨立管理。