1、企業可以聯系當地稅務機關，向其報告並說明情況，稅務機關會對個人的惡意申訴進行調查，發現存在虛假申訴的情況，可以追究個人的責任。
2、尋求法律幫助：個人的惡意申訴給企業造成了實際損失，企業可以通過法律途徑追究個人的民事責任，要求其承擔賠償責任。