對扣繳義務人按照規定扣繳的稅款，按年付給百分之二的手續費。不包括稅務機關、司法機關等查補或者責令補扣的稅款。扣繳義務人領取的扣繳手續費可用於提升辦稅能力、獎勵辦稅人員。
計算公式為：
應納稅額＝當期銷項稅額－當期進項稅額
銷項稅額＝銷售額*稅率
銷售額＝含稅銷售額/（1＋稅率）
銷項稅額：是指納稅人提供應稅服務按照銷售額和增值稅稅率計算的增值稅額。
進項稅額：是指納稅人購進貨物或者接受加工修理修配勞務和應稅服務，支付或者負擔的增值稅稅額。
註意事項：企業或個人在代扣代繳稅款時，應確保計算準確，避免因計算錯誤而影響手續費返還。
綜上所述，根據稅務局給出的保證金個稅金額的2%的退款，財務人員可通過自然人電子稅務局代扣代繳部分的“退款手續費核對”申請年度個人所得稅代扣代繳手續費。
法律依據：
《中華人民***和國個人所得稅法》
第十七條
對扣繳義務人按照所扣繳的稅款，付給2%的手續費。扣繳義務人領取的扣繳手續費可用於提升辦稅能力、獎勵辦稅人員。