如果個體工商戶是增值稅小規模納稅人，只能領取普通發票自行開具，稅務機關不會為其代 開普通發票；可以向稅務機關申請領用增值稅專用發票，申請通過後，只能領取增值稅專用發票自行開具，稅務機關不再為其代 開增值稅專用發票。
如果小規模納稅人的個體工商戶沒有向稅務機關申請領用增值稅專用發票，不能自行開具增值稅專用發票，那麽發生應稅銷售行為，需要開具增值稅專用發票的，就可以向稅務機關申請代 開增值稅專用發票。
另外，要註意的是，如果小規模納稅人達到壹般納稅人的標準（年應稅銷售額超過500萬元），則應當主動登記為壹般納稅人，領取增值稅專用發票自行開具；如果不按照規定登記為壹般納稅人，則稅務機關會按照壹般納稅人管理，並且不得抵扣進項稅額。這種情況稅務機關不會為其代 開增值稅專用發票。