該公司未代扣代繳個人所得稅，違反了稅法規定。壹經查實，稅務機關將責令該公司限期補繳，並可處以罰款。如果公司繼續逾期繳納，罰款會更高。另外，公司法定代表人給客戶回扣是違法的。客戶不構成非國家工作人員受賄罪的，應當盡快返還財物；雙方構成相關犯罪的，依法承擔刑事責任。如果公司偷稅漏稅，情節嚴重的不僅要罰款，還要面臨刑事責任。因此，公司應依法履行代扣代繳義務，確保合法合規經營。
個人所得稅扣繳的責任主體:
1.納稅人的義務:個人所得稅的納稅人是指取得應稅所得的個人；
2.扣繳義務人:單位或者個人繳納應納稅所得額時，代為扣繳個人所得稅；
3.自行申報:對無扣繳義務人的收入，納稅人應按時申報納稅；
4.稅務機關監管:稅務機關負責對個人所得稅的申報和繳納進行監督管理。
綜上所述，公司應依法履行代扣代繳義務，否則將面臨罰款及可能的刑事責任。
法律依據:
稅收征收管理法
第三十條
扣繳義務人應當依照法律、行政法規的規定履行代扣代繳、代收代繳稅款的義務。法律、行政法規規定沒有代扣代繳、代收代繳義務的單位和個人，稅務機關不得要求其代扣代繳、代收代繳稅款。扣繳義務人依法履行義務時，納稅人不得拒絕扣繳或者代收稅款。納稅人拒絕的，扣繳義務人應當及時報告稅務機關處理。稅務機關應當按照規定向扣繳義務人支付代扣代繳、代收代繳手續費。