1、用途不同：廣東稅務註冊賬號用於登錄電子稅務局，申報企業的增值稅、企業所得稅、印花稅等稅項的稅費，而個人所得稅賬號用於登錄自然人電子稅務局(扣繳端)，申報工資薪金、個人所得稅等個人所得稅項目。
2、所屬單位不同：廣東稅務註冊賬號屬於企業單位，而個人所得稅賬號屬於個人。