廣州市番禺區國家稅務局內設機構為11個，級別為正科級。 負責納稅人到稅務機關辦理的各種涉稅事項，具體包括稅務登記、納稅申報、稅款征收、稅款解繳、欠稅公告、發票購銷、稅法宣傳、金稅發售、報稅稽核、咨詢輔導和受理減免申請及有關優惠政策申請等。
機關黨委辦公室 負責單位的黨群、黨建工作；承擔思想政治工作和精神文明建設；指導工會、***青團、婦委會工作；承擔入黨積極分子的教育培訓考察工作及發展黨員工作。
離退休幹部科 承擔本單位離退休幹部的服務和管理工作。