1、收費公路通行費增值稅進項抵扣事項按照現行增值稅政策有關規定執行。增值稅壹般納稅人申報抵扣的通行費電子發票進項稅額，在納稅申報時應當填寫在增值稅納稅申報表附列資料（本期進項稅額明細）中‘認證相符的增值稅專用發票’相關欄次中。2、納稅人取得通行費電子發票後，應當登錄增值稅發票綜合服務平臺確認發票用途。稅務總局通過增值稅發票綜合服務平臺為納稅人提供通行費電子發票批量選擇確認服務。
通行費電子發票抵扣要求：1、須登錄增值稅發。票選擇確認平臺或至稅務大廳進行勾選認證。2、認證期限也為360日。3、納稅申報時填報在增值稅納稅申報表附列資料中”認證相符的增值稅專用發票相關欄次中。