根據百度地圖，南京市第二醫院位於江蘇省南京市鼓樓區中福路1-1號。附近公交站是中福路(市二院)，途經的公交車有13、42、72路。南京二院(南京中醫藥大學附屬南京醫院、徐州醫科大學南京第二臨床學院、東南大學附屬第二醫院)有中福校區和唐山校區兩個校區。