1.建立和完善公司的相關管理制度。
2、明確規範和約束供應商和貨代在出口退稅中的責任。
(二)加強部門之間的交流和銜接。
(3)各級人民高度重視，提高退稅風險防範意識。
(四)相關文件備案
1.外貿企業的購貨合同和生產企業非自產出口貨物的購貨合同，包括購銷合同項下簽訂的補充合同；
2.出口貨物清單；
3.出口貨物運輸單據(包括:海運提單、空運單、鐵路運單、貨物運輸單據、郵政收據等承運人簽發的貨物單據，以及出口企業承擔運費的國內運輸單據)。
(五)後續風險控制
逾期申報確因經辦人員失誤造成的，按稅收規定執行，予以免稅或視同內銷；及時與稅務管理部門溝通，爭取將公司損失降到最低。