超過容積率繳納出讓金的法律依據是:根據《中華人民共和國土地土地管理法》規定，以出讓等有償方式取得國有土地使用權的建設單位，必須按照國務院規定的標準和辦法，繳納土地使用費等費用後，方可使用土地。
土地超過容積率時補交土地出讓金的計算公式:變更容積率後補交土地出讓金-原容積率下補交土地出讓金。