醫院同工不同酬是違法的。因為我國《勞動法》明確規定，工資分配應當遵循按勞分配原則，實行同工同酬。
根據勞動法
第四十六條
工資分配應遵循按勞分配原則，實行同工同酬。工資水平在經濟發展的基礎上逐步提高。國家對工資總額實行宏觀調控。
第四十七條
用人單位應當根據本單位的生產經營特點和經濟效益，自主確定本單位的工資分配方式和工資水平。
第八十九條
用人單位制定的勞動規章制度違反法律、法規規定的，由勞動行政部門給予警告，責令改正；給勞動者造成損害的，應當承擔賠償責任。