1，法律效力不同。公章具有對外的法律效力，而專用章只能在單位內部有效使用。
2.規格和尺寸的法定要求不同。公章有統壹的法定規格、形狀和大小，而專用章的形狀和大小由單位自行規定，不受法律約束。
3.壹般公章是有法律效力的，比如單位的證明等文件。但是，對於增值稅發票，只允許使用發票專用章或財務專用章。