1.底棲生物棲息地破壞:航道拓寬需要深挖爆破，會破壞和擾亂底棲生物棲息地，導致部分生物種群減少或遷移。
2.水汙染:航道拓寬後，大型船舶會頻繁通過，會產生大量的泥沙、廢水等汙染物，汙染周邊水域，影響海洋生態系統的平衡和健康。
3.魚類生態系統:拓寬航道也會對魚類生態系統產生影響。拓寬後，流速和流向的改變會改變河口附近和沿岸的漁場結構，對生物多樣性和食物鏈產生負面影響。