設立專項慈善基金是基金會動員企事業單位和慈善家參與慈善的重要方式。專項資金之所以對捐贈者有吸引力，壹個重要原因是捐贈者可以為專項資金正名，享有較高的管理權限。
專項基金是公眾和輿論的敏感點，很多基金會在專項基金的問題上出現了危機。為了保證合規和透明，專項資金應在以下幾個方面進行管理。(1)信息披露和(2)專項審計。(3)項目評估。