南校區:位於吉林船營南涼城街2988號，占地640多畝。南校區主要提供學生住宿和部分教學服務，設施齊全，近年來發展迅速。
傳鷹校區:位於吉林省船營市雷波山風景區，距北校區15km。校園用於生態農業、農村發展和農業科技創新的教學、實踐和科研，擁有世界壹流的農業觀光莊園和農業實驗基地。