借調期間停發工資的，應及時與用人單位協商解決。協商不成的，可以向當地勞動監察機構投訴或申請勞動仲裁。勞動仲裁適用於各類勞動爭議，包括工資支付、解除勞動合同、工傷賠償等。借調期間停發工資，符合勞動爭議條件的，可以通過勞動仲裁解決。申請勞動仲裁時，需要提供相關證據材料，如工資單、借調協議等。
勞動仲裁的結果具有法律約束力。用人單位對仲裁結果不服的，可以向人民法院申請強制執行。因此，申請勞動仲裁是維護其合法權益的有效途徑。