醫院設有上海交大六院臨床醫學院、上海市糖尿病重點實驗室、上海市肢體顯微外科研究所、上海市糖尿病研究所、中國上海肢體顯微外科國際培訓中心、上海市醫學超聲培訓中心、上海交大創傷骨科研究所、上海交大糖尿病研究所、上海交大耳鼻喉科研究所、上海交大影像醫學研究所。
被譽為“中國超聲診斷的發源地”，先後獲得全國衛生系統先進集體、全國百家優秀愛嬰醫院等榮譽稱號。
擴展數據
醫院設有心血管內科、神經內科、呼吸內科、腫瘤科、腫瘤放療科、骨科、泌尿外科、神經外科、胸外科、整形外科、婦產科、生殖內科、兒科、口腔科、皮膚科、康復醫學科、感染性疾病科、中醫科、骨質疏松科、老年病科等臨床和醫療科室。
其中，醫院擁有6個國家臨床重點專科(骨科、內分泌與代謝、耳鼻喉科、影像醫學、運動醫學、急診醫學)，3個國家重點學科(骨科、內分泌與代謝、心血管疾病)，1國家中醫藥管理局重點專科(針灸科)。
上海市有兩個“重中之重”臨床醫學中心(代謝性疾病和創傷骨科)，上海市1“重中之重”臨床學科(耳鼻喉科)，上海市1“重點臨床專科。