Ig最顯著的生物學特征是它能與相應的抗原特異性結合,如細菌、病毒、寄生蟲、某些藥物或其他侵入體內的異物。Ig的這種特異性抗原結合特性是由其V區(尤其是V區的高變區)的空間組成決定的。Ig的抗原結合點由L鏈和H鏈高變區組成,與相應抗原上的表位互補。在靜電力、氫鍵和範德華力等次級鍵的幫助下,這種結合是可逆的,並受pH、溫度和電解質濃度的影響。在某些情況下,由於不同的抗原分子具有相同的抗原決定簇或相似的抗原決定簇,壹種抗體可以與兩種以上的抗原反應,這種反應稱為交叉反應。
抗體分子可以是單體、二聚體和五聚體,因此結合抗原決定簇的數量(結合效價)也不同。Fab片段是單價的,不能產生凝集反應和沈澱反應。f(ab’)2和單體免疫球蛋白(如IgG、IgD和IgE)是二價的。兩性IgA有四價。理論上,五聚體IgM的化合價應該為10,但實際上,由於三維構型的空間位阻,壹般只有5個結合位點可以結合抗原。B細胞表面的ig(SmIg)是特異性識別抗原的受體。成熟B細胞主要表達SmiIgM和SmIgD,識別同壹B細胞克隆中表達的不同SmIgs的抗原的特異性相同。