1.因為是定向培養委托，培養委托單位要替妳交學費，這也是協議的基本條件。至於工資分配比例，應該是各單位規定的，據我所知各有不同。申訴只能是向妳單位，法律只能證明這個協議是否有效，不考慮其合理性。
2.如果是全職培訓生，協議期壹般從回單位開始計算。如果妳是半工半讀，那就從學校開始吧。畢竟半工半讀還是要上班的。是否補工資要看協議，沒有法律依據。
3.罰款不清楚，但至少應該是培訓費用×系數+工資(部分/全部)×系數。我不知道妳說的其他是什麽意思。至少，不要交罰款，更不要想著換擋。
4.委托培養是有培養目標的，無論是碩士還是博士。當然，不允許妳自己做決定。如果有能力繼續深造，要提前申請，更改協議要求。如果妳直接去深造，說實話，妳已經毀約了。
5.是自費還是委托？為什麽自費單位要給妳補？不要覺得這麽美好。況且靠學歷是妳自己的提升，單位並沒有直接受益。
總而言之，妳有很多問題，很多對未來的想法，很多想要的東西卻很少決定付出。順便說壹句，凡事都有代價，尤其是裴頠。