1，從生態環境的角度。要求種苗基質基本不含活菌和蟲卵，不含或盡量少含有害物質，防止它們隨種苗進入生長地後汙染環境和食物鏈。為了達到這個標準，育苗基質要用金寶貝發酵劑快速發酵，達到殺菌、抗病毒、除卵的目的。
2.育苗基質應該具有類似於土壤的功能。從營養條件和生長環境來說，基質比土壤更有利於植物生長。但是，它仍然需要具有土壤的其他功能，如有利於根系纏繞(以消除腫塊)和更好的保水。。
3.育苗宜配制有機無機復合基質。在配制育苗基質時，要註意有機基質和無機基質的科學合理組合，以更好地調節育苗基質的通風、水分和營養。
4.選擇使用當地資源豐富、價格低廉的輕質基質。在應用穴盤育苗技術時，如何選擇育苗基質是關系到育苗成本和質量的首要問題。壹般情況下，應充分挖掘利用當地適宜穴盤育苗的輕型基質資源，降低育苗基質成本，從而降低穴盤育苗的銷售價格。根據各地實際情況，選擇炭化稻殼、棉籽殼、鋸末、蛭石、珍珠巖等低成本基質作為穴盤育苗基質。