1，車輛合格證壹般由車管所保管。車輛合格證在交付時與車輛壹起交給車主。新車上牌時，車輛合格證原件需要由車管部門歸檔保存。有證的車才能達到國家對機動車裝備質量及相關標準的要求。
2.法律依據:《中華人民共和國道路交通安全法》第九條。
申請機動車登記，應當提交下列證件和憑證:
(壹)機動車所有人的身份證明；
(二)機動車來歷證明；
(三)機動車整車出廠合格證或者進口機動車進口證明；
(四)車輛購置稅完稅證明或免稅證明；
(五)法律、行政法規要求在機動車登記時提交的其他證明、憑證。
公安機關交通管理部門應當自受理申請之日起五個工作日內完成機動車登記審核，對符合前款規定條件的，應當核發機動車登記證書、號牌和行駛證；申請人不符合前款規定條件的，應當向申請人說明不予註冊的理由。
除本法另有規定外，公安機關交通管理部門以外的任何單位或者個人不得發放機動車號牌或者要求機動車懸掛其他號牌。
機動車登記證書、號牌、行駛證的樣式由國務院公安部門規定並監制。
二、買車後多久能拿到車輛合格證？
車輛合格證壹般在買車後當天給。車輛合格證要在車管所備案，車輛合格證不退還車主。如果購買新車，需要攜帶身份證、車輛合格證、購置稅完稅證明、保險單、購車發票等。去車管所領證。車管所工作人員對車輛進行檢查後，車主即可選號領證。