1，報考條件不同:任何人都可以報考自考本科，在報考本科畢業證的時候會檢查專科畢業證，也就是說專科和本科都可以同時報考，報考機會很多。但只有高職院校應屆畢業生或大專畢業後服義務兵役退役的陜西籍軍人才能報考，且大專畢業當年只有壹次報考機會。
2.錄取方式不同:自考不設聯考，全省統壹高考。
3.學生的管理機構不同:自考是各級自考辦公室，本科是高等院校。
4.學制不同:自考沒有學制，可以考十年八年。本科教育有學制，壹般是兩年。
5.學習方式不同:自學是自己安排時間，也可以參加自習班參與輔導。本科是在學校參加全日制學習。
6.畢業方式不同:通過入學考試後，進入高等院校學習，在規定年限內完成全部課程即可畢業。自考的話，必須學完申請專業的所有科目，考試合格，才能申請畢業證。
7.畢業證書的頒發機構不壹樣。自考是高等教育自學考試委員會，是高等學校，本科是高等學校。本科教育壹般被認為是原始教育(第壹次教育)，自考屬於後續教育。
8.考核內容不壹樣。因為普通院校和自考的學習方式不同，所以大綱和考核內容也有很大差異。